Lasem yang merupakan kawasan dengan struktur masyarakat sosial multietnnis, heterogen menjadikan nafas, arah tujuan berdirinya STAI Al Hidayat. Oleh karenanya, visi yang terumuskan adalah “Menjadi Pusat Kajian dan Pengembangan ilmu keislaman dalam mewujudkan masyarakat yang damai, moderat, bermartabat dan mandiri”. Sedangkan dalam misi yang akan dilakukan dengan menyelenggarakan pendidikan dan pembelajaran yang berorientasi pada terwujudnya masyarakat yang damai dan bermartabat serta berprilaku moderat dan berjiwa kemandirian, Menyelenggarakan penelitian dan publikasi yang berkontribusi pada pengem-bangan kajian keislaman dalam mewujudkan masyarakat yang damai dan bermartabat serta berprilaku moderat dan berjiwa kemandirian, Menyelenggarakan pengabdian kepada masyarakat yang barbasis pada terwujudnya masyarakat yang damai dan bermartabat serta berprilaku moderat dan berjiwa kemandirian, Berperan sebagai pusat pengembangan perguruan tinggi berbasis pesantren yang berhaluan Aswaja an-Nahdliyyah yang menjunjung tinggi nilai-nilai multiku-ltural, Menyelenggarakan kerja sama dan tata kelola dengan prinsip good governance.

Sedangkan tujuan secara umumnya adalah Menghasilkan sivitas akademika yang berjiwa pengabdian tinggi serta berprilaku moderat dan memiliki kompetensi di bidangnya serta mandiri, Menghasilkan produk penelitian dan publikasi yang memberi kontribusi kepada masyarakat untuk saling hidup damai dan berprilaku moderat dan mandiri, Mengahasilkan produk pengabdian masyarakat yang menjujunjung tinggi nilai kedamaian dan prilaku moderat dan mandiri, Menghasilkan sivitas akademika yang menjadi percontohan serta berprinsip kepesantrenan yang berhaluan aswaja an-nahdliyyah yang menjunjung tinggi nilai-nilai multikultural, Mewujudkan kerja sama dan pengelolaan Perguruan Tinggi berbasis pesantren yang terencana dan berkelanjutan.

Adapun tata nilai yang dijunjung tinggi oleh Sekolah Tinggi Agama Islam Al Hidayat Lasem sebagai berikut, Akhlaqul Karimah, Keteladanan, Kebersamaan, Kebangsaan, Penguatan sivitas akademika untuk bersikap tanggap dan menghargai nilai-nilai multicultural.